新華醫院重磅突破:AI診斷罕見病精度刷新世界紀錄,腦內精准基因編輯可行性被驗証
兩大成果同日在線刊發於《自然》
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收藏新春佳節之際,中國人工智能與醫學交叉領域迎來重磅突破:北京時間2月19日凌晨,國際頂級學術期刊《自然》在線刊發上海交通大學醫學院附屬新華醫院孫錕教授、余永國教授領銜團隊與上海交通大學人工智能學院張婭教授、謝偉迪副教授領銜團隊的聯合研究成果。這款全球首個可溯源智能體式罕見病診斷系統DeepRare,憑借首創Agentic AI架構破解罕見病診斷世界性難題,診斷精度刷新世界紀錄,其相關應用已服務全球600余家頂尖醫療科研機構,為全球罕見病患者點亮確診希望。
同日,《自然》還在線發表了另一項來自中國的重磅成果。這項研究驗証了腦內精准基因編輯的可行性,讓全球神經發育疾病患者家庭看到了治療的曙光。這一研究成果由上海交通大學醫學院附屬新華醫院發育行為兒童保健科及教育部—上海市環境與兒童健康重點實驗室教授李斐、副研究員楊侃團隊與上海交通大學醫學院鬆江研究院仇子龍教授團隊、復旦大學腦科學轉化研究院研究員程田林團隊和中國科學院分子細胞科學卓越創新中心李勁鬆院士團隊合作完成。
破解罕見病基層篩查困境
罕見病確診難、漏診率高是全球醫療領域的共同痛點,此次上海交大與新華醫院聯合團隊協同多方科研力量攻關,為DeepRare打造了全球首創的“中樞—分身”可溯源Agentic AI架構,從三個維度實現對傳統醫療AI的代際超越,讓AI診斷擁有了“清晰的診療思路”。
在知識儲備上,DeepRare打破醫學數據孤島,如同連接了全球所有頂尖醫學圖書館和臨床案例庫,實時整合海量醫學文獻知識庫與真實臨床病例數據﹔在診斷思維上,它跳出傳統AI的“模式匹配快思考”,能主動提問補充患者信息,通過“假設—驗証—自我反思”的迭代循環推敲診斷線索,修正邏輯漏洞﹔在推理過程上,它實現全流程白盒推理,每一個診斷結論都附帶完整証據鏈條,讓醫生既能知道診斷結果,更清楚診斷依據,徹底破解AI醫療的“信任難題”。
孫錕坦言,罕見病診療長期面臨“不測基因就難確診”的行業困境,尤其在缺乏基因檢測條件的基層醫院,罕見病篩查更是難上加難。而DeepRare的出現,實現了罕見病表型篩查性能的跨越式提升,用硬核數據交出了亮眼答卷。
論文實測數據顯示,在僅提供患者臨床表型信息、無基因數據的情況下,DeepRare表型診斷首位准確率達57.18%,較此前國際最佳模型提升23.79個百分點。這一裡程碑式突破,為基層醫院打造了一把罕見病快速篩查的“金鑰匙”,讓基層無需依賴復雜基因檢測,也能開展高效的罕見病初篩。引入基因測序數據后,DeepRare的診斷效能進一步升級,在復雜病例中的綜合首位診斷准確率突破70.6%,顯著優於國際通用的Exomiser工具(53.2%)。更值得一提的是,其生成的帶完整証據鏈的推理報告,獲得了新華醫院專家團隊95.4%的高度認可,真正做到了診斷“有理有據、精准可靠”。
DeepRare並未停留在論文層面,其應用落地早已先行一步,成為全球罕見病診療領域的實用工具。基於該成果的DeepRare罕見病在線診斷平台(https://deeprare.cn/)已於2025年7月26日正式上線,短短半年,已吸引超千名專業用戶注冊,覆蓋全球600余家醫療及科研機構。
下一步,為將這一“中國方案”推廣至全世界,聯合團隊正積極籌備發起“全球AI罕見病診療聯盟”,並同步啟動“萬人臨床驗証計劃”。團隊計劃在未來半年內,依托全球聯盟網絡,完成2萬例疑難罕見病的真實世界驗証。
有望破局單基因缺陷神經疾病
以自閉症為代表的神經發育性疾病,正困擾著無數家庭,長期以來“無藥可用”的困境讓患者家庭背負著沉重的身心與經濟壓力。李斐團隊此次研究聚焦的Snijders Blok–Campeau綜合征(SNIBCPS),就是一種典型的神經發育性疾病。其“罪魁禍首”已被明確——CHD3基因的突變。這個基因的異常會導致兒童神經發育障礙,出現自閉症特征、全面發育遲緩、語言障礙、智力障礙及肌張力低下等一系列問題,給患者成長和家庭生活帶來極大挑戰。長期以來,由於病因復雜、靶向困難,該病始終缺乏針對性治療方法。
要從根源上解決問題,關鍵在於精准修復“出錯”的基因位點。研究團隊創新性地設計了一款新型腺嘌呤鹼基編輯器TeABE,它能精准識別並將突變的A·T鹼基對修復為正常的G·C鹼基對,整個過程不會破壞DNA的整體結構,大幅降低了基因編輯過程中可能出現的基因組紊亂風險。
基因治療的臨床轉化,安全性是重中之重。為了確保這款“基因編輯器”的安全性,研究團隊通過GUIDE-seq技術在全基因組范圍內“排查”可能的脫靶位點。結果顯示,在人類細胞中潛在的脫靶位點編輯率均低於1%。此后,研究團隊在非人靈長類(獼猴)模型中也開展了鞘內注射AAV9-TeABE實驗。結果顯示,編輯器在獼猴腦內高效表達並完成拼接,成功檢測到明確的鹼基編輯活性。這一成果不僅証明了該技術具備跨物種應用的可行性,更為后續臨床試驗積累了充足的前期數據。
目前,李斐團隊已在規劃下一步實驗,包括優化編輯器結構、探索更安全的遞送方式、建立人源類器官疾病模型以及構建大型動物長期安全性評價體系等。希望不久的將來,基於鹼基編輯的基因治療策略將為更多神經發育疾病患者帶來希望。(記者 黃楊子)
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